© Crédit Vincent Moncorgé 2017

Yad Ghavi-HelmInstitut de génomique fonctionnelle de Lyon (IGFL) CNRS / ENS Lyon / Université Claude Bernard Lyon 1 / INRA

ATIP-Avenir
Régulation de l’expression des gènes par les enhancers
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Mes recherches

Biologiste moléculaire de formation, je m’intéresse à la régulation de l’expression des gènes au cours du développement embryonnaire dans le contexte de l’organisation tridimensionnelle de la chromatine. Après une thèse réalisée au CEA-Saclay portant sur la régulation de la transcription chez la levure Saccharomyces cerevisiae, j’ai rejoint l’équipe d’Eileen Furlong à l’European Molecular Biology Laboratory (EMBL) à Heidelberg en Allemagne, d’abord comme post-doc, puis comme chercheur. J’ai ensuite été recrutée au CNRS en tant que chargé de recherche de première classe en 2017, et ai créé la même année l’équipe « Epigénomique développementale » à l’Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL – ENS de Lyon) grâce au soutien des financements ATIP-Avenir, « Amorçage de Jeunes Equipes » de la Fondation pour la Recherche Médicale, et ERC Starting grant. 

Mon projet ATIP-Avenir

Regulatory genomics during Drosophila embryogenesis: functional dissection of enhancer-promoter interactions

Enhancer3D

In eukaryotes, the complex regulation of temporal- and tissue-specific gene expression is controlled by the binding of transcription factors to enhancers, which in turn interact with the promoter of their target gene(s) via the formation of a chromatin loop. Despite their importance, the properties governing enhancer function and enhancer-promoter loops in the context of the three-dimensional organisation of the genome are still poorly understood.

My recent work in flies showed that: (i) developmental genes are often regulated by multiple enhancers, sometimes located at unexpectedly large distances, (ii) the spatio-temporal activity of most enhancers is still unknown, (iii) many enhancer-promoter interactions are established far before the onset of their target gene expression and remain stably associated over consecutive stages of embryogenesis, and (iv) stable enhancer-promoter interactions often correlate with the presence of paused RNA Polymerase II at the promoter before gene activation.

Building upon these results, we aim understanding the determinants of promoter-enhancer interaction specificity during Drosophila embryogenesis.

Yad Ghavi-Helm est également lauréate ERC Starting Grant 2017