Mathieu GabutCentre de recherche en cancérologie de Lyon (CRCL) - CNRS / Inserm / Université Claude Bernard Lyon I / Centre Léon Bérard
Mes recherches
J’ai réalisé ma thèse (2002-2006) à l’Institut de génétique moléculaire de Montpellier au sein du laboratoire du Pr. Jamal TAZI, sous la direction de Yohann SORET, durant laquelle je me suis intéressé au mécanisme d’épissage alternatif des ARN messagers. J’ai ensuite rejoins le laboratoire du Dr. Benjamin BLENCOWE, au Donnelly Centre à l’Université de Toronto en tant que chercheur post-doctorant (2007-2012), afin d’étudier le rôle de la régulation de l’épissage alternatif sur le contrôle de l’identité des cellules. J’ai été recruté à l’INSERM en 2012 au sein de l’équipe dirigée par Didier AUBOEUF au Centre de recherche en cancérologie de Lyon (CRCL), en qualité de CR1. Suite à l’obtention de l’ATIP-Avenir en 2013, j’ai créé mon équipe de recherche « Diversité du transcriptome des cellules souches » en 2014 au CRCL. Avec le Pr. François DUCRAY, neuro-oncologue aux Hospices Civils de Lyon, nous essayons aujourd’hui de décortiquer les mécanismes moléculaires qui contrôlent l’identité et la plasticité des cellules souches cancéreuses responsables de tumeurs cérébrales, en particulier des glioblastomes. En combinant des approches de biochimie, de biophysique et de transcriptomique, mes travaux de recherche visent à établir comment les mécanismes post-transcriptionnels, tels que l’épissage, la stabilité des ARNm et la traduction, régulent directement le phénotype des cellules souches cancéreuses et leur capacité à promouvoir la tumorigénèse dans un contexte de résistance thérapeutique.
Mon projet ATIP-Avenir
Regulation of transcriptome diversity in self-renewing cells: an emerging role for alternative splicing in embryonic and cancer stem cell maintenance.
REAC-STEM
Pluripotency and self-renewal are fundamental properties underlying the function of embryonic (ESC) and adult stem cells. These capacities are regulated by gene networks which expression is tightly controlled to insure proper cell fate decisions. Alterations of these regulatory networks can disrupt the balance between proliferation and differentiation leading to tumor formation. Indeed, tumors are hierarchically organized cell populations initiated and maintained by cancer stem cell (CSC) subpopulations which share many similarities with normal stem cells. Defining the molecular pathways controlling self-renewal and pluripotency maintenance is thus not only important to understand normal development but could also reveal new strategies to target the CSCs.
We recently revealed a central role for alternative splicing (AS) in the regulation of the core ESC pluripotency regulatory circuitry. Although AS affects 95% of multi-exon human genes, the extent and significance of the differential regulation of AS for stem cell fate decisions remains largely unclear. We will further characterize the importance of AS for the regulation of molecular pathways controlling ESC and brain CSC maintenance.