Génomique et écologie évolutive des plantes polyploïdes : dynamique temporelle à différentes échelles d’organisation biologique, des molécules aux écosystèmes

Présidente : Malika Ainouche

Université de Rennes, UMR CNRS 6553 Ecobio, Bât. 14 A Campus de Beaulieu, Avenue du Général Leclerc, 35042 Rennes Cedex, France

Tel : +33 (0)6 52 19 33 78

Email: mlainouche@univ-rennes.fr

Vice-président : Jonathan Wendel

Dept of Ecology, Evolution, and Organismal Biology, Iowa State University, Ames, IA 50011, USA 

Tel : +1 515 294 7172

Email: jfw@iastate.edu

La Révolution de la Génomique Haut-Débit a mis en évidence le rôle de la polyploïdie (résultant de duplication du génome entier) comme mécanisme central de diversification biologique chez les plantes, conduisant à l’adaptation et à la spéciation. Il est à présent acquis que toutes les lignées végétales contemporaines contiennent des génomes dérivant d'un ou plusieurs cycles anciens et plus ou moins récents de polyploïdie suivi(s) chacun par un spectre diversifié de processus écologiques et évolutifs qui conduisent à la génération de nouveaux clades et de nouvelles adaptations. Notre compréhension croissante de l'impact de la polyploïdie a conforté sa pertinence pour de multiples disciplines et à différentes échelles d'organisation biologique. La polyploïdie est un sujet important en agronomie, en raison de la prévalence du doublement du génome entier chez les plantes cultivées. De même, d’un point de vue écologique, la polyploïdie s’avère particulièrement impliquée en biologie des invasions et dans les processus adaptatifs. 

L'un des principaux défis à relever vise la compréhension des connexions moléculaires, (génomiques et autres « omiques ») qui sous-tendent l'adaptation et les nouveaux phénotypes. Les deux dernières décennies ont ainsi vu l’explosion des études analysant les duplications génomiques des espèces actuelles. De nouvelles questions ont émergé sur notre vision rétrospective de l’histoire évolutive de ces génomes (par exemple, pourquoi et comment les génomes dupliqués reviennent à l'état « diploïde », les processus de fractionnement du génome, leurs conséquences adaptatives à court et à long terme). Cette Conférence vise à réunir les experts internationaux scientifiques de diverses perspectives biologiques, des niveaux moléculaires aux niveaux écologique. La conférence se concentrera sur les questions émergentes concernant les polyploïdes à des échelles de temps allant de millions d'années aux processus contemporains, et à travers toute l'échelle biologique, des molécules aux communautés. Les thèmes s’articuleront autour de quatre sessions : (1) Dynamique évolutive des génomes polyploïdes (2) Comment les plantes s'adaptent au doublement du génome (3) Processus génétiques et épigénétiques façonnant la régulation des génomes dupliqués (4) Conséquences écologiques de la polyploïdie.

Conférenciers invités

(titres provisoires)

BARKER Michael (Department of Ecology & Evolutionary Biology, University of Arizona, USA)
Diploïdisation, polyploïdie et évolution de la diversité des plantes

BONNEMA Guusje (Department of Plant Sciences, University of Wageningen, Pays-Bas) 
Contribution des échanges homéologues et de l’introgressions inter-ploïdie à la domestication des Brassica polyploïdes

CASACUBERTA Josep (Center for Research in Agricultural Genomics, Barcelone, Espagne) 
Dynamique des LTR-rétrotransposons au cours de l’évolution récente du cotonnier 

CHOULET Frédéric (INRAE INRAE Site de Crouël, Clermont-Ferrand, France) 
Dynamique des éléments transposables chez le blé hexaploïde et les espèces sauvages apparentées 

CONOVER Justin (Molecular and Cellular Biology Department, University of Arizona, Tucson, USA) 
Génomique des populations et mutations délétères à travers le spectre autopolyploïde - allopolyploïde

D’HONT Angélique (CIRAD, Montpellier, France) 
Séquençage de génomes et histoire complexe d’admixture révélée au cours de la domestication de la canne à sucre et de la diversification des cultivars

GLEMIN Sylvain ¸(CNRS UMR Ecobio, Université de Rennes, France)
Niveaux de ploïdie, systèmes de reproduction et compétition : Exemple des capselles 

HU Guanjing (Agricultural Genomics Institute at Shenzhen, Chine)
Dynamique des réseaux de régulation des gènes dupliqués gouvernant le développement et la tolérance au stress chez les cotonniers  

KOLAR Filip (Department of Botany, Faculty of Science Charles University, Praha, République Tchèque) 
Adaptation dans les populations naturelles autopolyploïdes 

KOVARICK Ales (Institute of Biophysics, Academy of Sciences of the Czech Republic, Brno, République Tchèque) 
Curieux niveaux de ploïdie chez Rosa canina : Fantaisies des appariements chromosomiques et évolution des plantes

LASCOUX Martin (Uppsala University, Suède) 
Rôle de l’hybridation et du doublement du génome dans l’évolution d’une espèce cosmopolite allotétraploide 

LEITCH Andrew (Queen Mary University of London, Royaume Uni) 
Réduction de la taille des génomes suite à la polyploïdie : mécanismes, intensité et pressions sélectives

LEITCH Ilia (Royal Botanic Gardens Kew, Royaume Uni) 
Impact de la polyploïdie sur l’évolution de la taille des génomes

MANDAKOVA Terezie (Mazaryk University, Brno, République Tchèque) 
Méesopolyploïdie et diploïdisation post-polyploïde chez les Brassicacées 

MASON Annaliese (INRES - Pflanzenzüchtung Bonn, Allemagne) 
Contribution des hybrides synthétiques de Brassica à la compréhension de la stabilisation de la méiose chez les polyloïdes

NOVIKOVA Polina (Max Planck Institute for Plant Breeding Research, Köln, Allemagne) 
Processus impliqués dans l’établissement des polyploïdes

PARISOD Christian (Département de Biologie, Université de Fribourg, Suisse) 
Duplications génomiques et radiation écologique 

ROUSSEAU-GUEUTIN Mathieu (IGEPP, INRAE, Le Rheu, France) 
Voies de formation des polyploïdes, recombinaison méiotique et succès de la spéciation

SALMON Armel (UMR CNRS Ecobio, Université de Rennes, France)
De la cytogénétique classique à l’ère post-génomiques : Niveaux de ploïdie et histoire des génomes revisitée chez Sporobolus (Poaceae) 

SERRA Heïdi (Institut de Génétique, Reproduction et Développement, CNRS/ INSERM/Université Clermont Auvergne, Clermont-Ferrand, France)
Adaptation méiotique à l’allopolyploïdie

SOLTIS Pamela (Florida Museum of Natural History, USA) 
Polyploïdie et changements rapides : Les enseignements des polyploïdes récemment formés dans la nature

VAN DE PEER Yves (VIB UGent Center for Plant Systems Biology, Belgique) 
Duplications génomique, survie, potentiel évolutif et adaptatif en périodes de bouleversements environnementaux

VEKEMANS Xavier (Université de Lille, Villeneuve d’Ascq, France) 
Auto-incompatibilité chez les plantes, évolution des systèmes de reproduction et succès des lignées polyploïdes

WINCKER Patrick (Genoscope, Evry, France) 
Génomique comparative des organismes polyploïdes photosynthétiques
 

Date limite d’inscription : 5 mai 2025

Droits d'inscription, incluant les frais de séjour (chambre et repas) 

550€ pour les doctorants

770€ pour les autres participants

Dépôt des candidatures pour inscription 

Le nombre de participants est limité à 115 personnes. Les scientifiques et étudiants en thèse intéressés par la conférence doivent déposer sur le site lien à venir, avant la date limite :

• leur curriculum vitae
• la copie de leur carte d'étudiant
• la liste de leurs principales publications des trois dernières années
• le résumé de leur présentation :

Le résumé doit respecter le format suivant : 

• 1ère ligne : Titre
• 2ème ligne : Nom(s) des auteur(s)
• 3ème ligne : Adresse(s) des auteur(s)
• 4ème ligne : Adresse mail de l'auteur présentant les résultats

Le résumé doit faire au maximum 600 mots, pas de figures.

Après la date limite, les organisateurs sélectionneront les participants. Sauf exception admise par le président, il est souhaitable que les candidats sélectionnés présentent leurs travaux pendant la conférence, soit sous forme d'affiche, soit par une brève communication orale en séance. Les organisateurs choisiront la forme sous laquelle se feront les présentations. Les informations sur le mode et la date de paiement seront adressées en temps voulu aux participants sélectionnés.