Génomique écologique intégrative

Roscoff (Bretagne), France, 15-19 octobre 2011

 

Date limite d'inscription : 22 juillet 2011

 

Président : Oded BÉJÀ

Faculty of Biology, Technion, Israel Institute of Technology, Haifa 32000, Israël
Téléphone : +972-4-829-3961 – Télécopie : +972-4-822-5153
Mèl : Beja@tx.technion.ac.il

 

Vice-Président : Philippe VANDENKOORNHUYSE

CNRS - UMR 6553, Ecobio IFR2116/FR90 CAREN, Université de Rennes I, Campus de Beaulieu,
35000 Rennes (France)
Téléphone : +33 2 23 23 50 07 – Télécopie : +33 2 23 23 68 28
Mèl : Philippe.Vandenkoornhuyse@univ-rennes1.fr

 

Quinze années se sont écoulées depuis le séquençage du premier génome bactérien (Fleischmann et al., 1995). Ces dernières années, différentes initiatives de grande ampleur ont été lancées afin d'améliorer la représentation de la biodiversité dans les banques de données. Le déchiffrage des génomes de ces organismes a ainsi permis de mieux comprendre comment ils exploitent les ressources dans leur environnement, interagissent entre eux et s'adaptent aux changements environnementaux. Ces séquences génomiques sont également très importantes pour reconstruire l'histoire évolutive des organismes vivants (Mulkidjanian et al., 2006; Boussau et al., 2008).

L'analyse de ces génomes procaryotes et eucaryotes a aussi révélé l'énorme variabilité des répertoires de gènes et/ou des structures génomiques non seulement entre espèce proches, mais aussi entre organismes appartenant à la même espèce.

L'émergence récente de la Génomique Environnementale découle de ces résultats de génomique structurale et fonctionnelle et de génétique/génomique des populations et prend en compte la nécessité d'une vision intégrative directe de la complexité des milieux et de la biodiversité afin de limiter les biais d’interprétation des phénomènes écologiques observés.

Le thème central de la conférence Jacques Monod 'génomique écologique intégrative' vise par les  sessions organisées à présenter les dernières avancées dans les champs de la génomique et de la post-génomique en écologie. Ainsi les concepts et les idées émergentes de l'écologie fonctionnelle et évolutive liés au développement de la génomique environnementale seront développés.

 

Conférenciers invités

(Titres provisoires)

 

BEAUMONT Hubertus (Leiden, Pays-Bas)
Exploration de la capacité évolutive et évolution expérimentale du 'bet-hedging'

BÉJÀ Oded (Haifa, Israel)
Métagénomique des gènes photosynthétiques viraux

BOETHIUS Antje (Bremen, Allemagne)
Du littoral aux abysses - Niveaux de biodiversité microbienne dans les sédiments marins

DELNERI Daniela (Manchester, Royaume Uni)
Génomique environnementale de la levure

DE VARGAS Colomban (Roscoff, France)
Protistomique océanique: les liens entre gènes et phènes en écologie globale

FORTERRE Patrick (Paris, France)
Co-évolution entre virus, plasmides et génomes cellulaires chez les  Archaea

GARCZAREK Laurence (Roscoff, France)
Adaptation des cyanobactéries marines du genre Synechococcus à diverses niches écologiques : apports de la génomique comparative et de la métagénomique

KOONIN Eugene (Bethesda, USA)
Génomique, Ecologie, Evolution : la convergence

LEY Ruth (Ithaca, USA)
Contrôle de la diversité microbienne intestinale par le système immunitaire de l'hôte

LOPEZ-GARCIA Purification (Orsay, France)
Métagénomique des Archaea planctoniques de mers profondes

MARTIN Francis (Nancy, France)
Les communautés fongiques du sol : des génomes aux biomes

MEYER Folker (Argonne, USA)
Renversement de paradigme - La séquence complète du génome de Candidatus Sulfuricurvum sp. provenant d’une analyse métagénomique  en séquences courtes permet la mise en culture et la caractérisation de cette nouvelle epsilon-protéobacterie.

MORAN Mary Ann (Athens, USA)
Métatranscriptomique : comment espionner l’expression génétique des communautés.

MORAN Nancy (Tucson, USA)
Intégration des génomes des symbiotes et des  hôtes pour exploiter de nouvelles niches écologiques

ORPHAN Victoria (Pasadena, USA)
Associations microbiennes consommatrices de méthane en mer profonde

ROHWER Forest (San Diego, USA)
'Microbialisation' des récifs coralliens planétaires

SCHLEPER Christa (Vienna, Autriche)
Diversité physiologique des Archaea oxidant l'ammonium : prédictions à partir de génomes et de métagénomes testés en cultures et métacultures

SOREK Rotem (Tel Aviv, Israël)
Transcriptomique microbienne et métatranscriptomique

TABERLET Pierre (Grenoble, France)
Analyses d'échantillons environnementaux : identification haut-débit basée sur le concept du code-barre ADN

VANDENKOORNHUYSE Philippe (Rennes, France)
Un effet 'Arche de Noë' pour les microorganismes d'écosystèmes isolés ?

VEKEMANS Xavier (Lille, France)
Génomique de l'autoincompatibilité

VOGEL Timothy (Ecully, France) 
Métagénomique comparative : des fonctions écosystémiques spécifiques ?

VORHOLT Julia (Zürich, Suisse)
Microbiologie de la phyllosphère : les leçons de la métaprotéogénomique

WILLERSLEV Eske (Copenhagen, Danemark)
A la recherche du passé moléculaire

YOUNG Peter (York, Royaume Uni)
Génomique des populations de Rhizobium: une exploration de l'espace

ZENGLER Karsten (San Diego, USA)
Le déchiffrage des interactions microbiennes : Intégration de la Biologie des Systèmes et de l'Écologie Microbienne

 

Date limite d'inscription : 22 juillet 2011

 

Droits d'inscription, incluant les frais de séjour (chambre et repas)

350 € pour les doctorants
560 € pour les autres participants

 

Dépôt des candidatures pour inscription

Le nombre de participants est limité à 115 personnes. Les scientifiques et étudiants en thèse intéressés par la conférence doivent adresser :

• leur curriculum vitae
• la liste de leurs principales publications des trois dernières années
• le résumé de leur présentation

 

sur la page http://ieg2011.univ-rennes1.fr/news.php dédiée aux candidatures d'inscriptions.

Après la date limite, les organisateurs sélectionneront les participants. Sauf exception admise par le président, il est souhaitable que les candidats sélectionnés présentent leurs travaux pendant la conférence, soit sous forme d'affiche, soit par une brève communication orale en séance. Les organisateurs choisiront la forme sous laquelle se feront les présentations. Les informations sur le mode et la date de paiement seront adressées en temps voulu aux participants sélectionnés.