Évolution virale sur le continuum mutualiste - parasite

Roscoff (Bretagne), France, 21-25 octobre 2019

Date limite d'inscription : 21 juin 2019

Président : Samuel Alizon

Laboratoire MIVEGEC (CNRS, IRD, Université de Montpellier), IRD, 911 Avenue Agropolis, BP 64501 34394 Montpellier Cedex 5 France
Tel : +33 (0)4 48 19 18 67
Email: samuel.alizon@cnrs.fr

Vice-président : Paul Turner

Yale University, Microbiology Faculty, Yale School of Medicine New Haven, CT 06520, USA
Tel : +1 203 432 5918
Email: paul.turner@yale.edu

Depuis leur découverte il y a plus d'un siècle, les virus suscitent fascination et controverse. Par exemple, leur statut d'organisme vivant est souvent remis en cause mais, dans le même temps, on les soupçonne d'avoir joué un rôle clé dans l'évolution de la vie. Les virus sont également l’objet de toutes les peurs, notamment en raison des récentes épidémies de Zika et d’Ebola ; pourtant, ils sont de plus en plus utilisés pour lutter contre les maladies, par exemple avec la thérapie phagique ou des traitements anti-cancer. La quasi-totalité de ces risques et bénéfices découle de cette capacité qu’ont virus à évoluer rapidement. Ceci leur permet aussi d’émerger sur de nouvelles espèces hôtes, de résister aux médicaments et d’échapper aux vaccins, tout en permettant des développements technologiques rapides.

L'évolution virale se révèle très utile pour les recherches fondamentales et appliquées. Au niveau expérimental, elle fournit une puissance unique pour tester des questions biologiques générales, par exemple l’évolution de la coopération. À un niveau plus appliqué, les nouvelles technologies peuvent être utilisées pour surveiller la dynamique virale en temps réel dans les systèmes biologiques. Par exemple, l'analyse génomique permet de déchiffrer l'histoire évolutive et l'épidémiologie des virus. En règle générale, on découvre un rôle croissant des virus dans le fonctionnement des environnements naturels et les microbiotes. Enfin, l’importance de l’évolution virale est de plus en plus prise en compte dans les politiques de santé publique. Ces nombreuses idées conceptuelles et avancées technologiques soulignent que la recherche sur l'évolution des virus est particulièrement d’actualité.

Cette conférence abordera cette variété de sujets vitaux en lien avec l'évolution des virus. Elle réunira une communauté internationale de chercheurs utilisant des approches diverses (recherche clinique, modélisation mathématique, évolution expérimentale en laboratoire, biologie moléculaire, bioinformatique, immunologie, biotechnologie) pour étudier des virus infectant une grande diversité d’hôtes, notamment bactéries, protozoaires, plantes et animaux. L'un des objectifs sera d'identifier des questions de recherche prometteuses dans le domaine pour les années à venir.

Conférenciers invités
(titres provisoires)

Samuel Alizon (Montpellier, France)
Pourquoi les virus nuisent-ils à leurs hôtes? Le cas des HPV

Raul Andino (San Francisco, USA)
Évolution intra-hôte des virus à ARN et pathogénèse

Megan Baldridge (St Louis, USA)
Régulation par le système immunitaire de l’évolution in vivo de norovirus

Monsef Benkirane (Montpellier, France)
Impact de l'organisation 3D du génome sur la sélection des sites d'intégration du VIH

Ignacio Bravo (Montpellier, France)
Préférence d’usage des codons et évolution des styles de vie des virus

Siobain Duffy (Rutgers, USA)
Contraintes sur l’expansion de la gamme d’hôte chez les virus ARN

Christophe Fraser (Oxford, United Kingdom)
Signatures hôtes et virale affectant la virulence du VIH-1

Fernando Garcia-Arenal (Madrid, Spain)
Évolution de la gamme d’hôtes en environements hétérogènes

Clement Gilbert (Gif-sur-Yvette, France)
Transfert horizontal de matériel génétique entre les virus et leurs hôtes

Katia Koelle (Emory, USA)
Coopération et défection dans les populations de virus influenza

Eugene Koonin (Bethesda, USA)
Inévitabilité des parasites génétqiues et leur rôle clé dans l’évolution de la vie

Philippe Lemey (Louvain, Belgium)
Inférence phylodynamique : de l’inférence des histoires évolutives anciennes aux épidémies contemporaines

Alice McHardy (Helmholtz, Germany)
Prédire l’évolution des virus de l’influenza A humaine

Yannis Michalakis (Montpellier, France)
Vivre avec un génome éparpillé: vers une compéhension des virus multipartites et de leur mode de vie

Marie-Agnes Petit (Jouy-en-Josas, France)
Croissance des bactériophages dans l’intestin: jusqu’où et jusque quand ?

Gwenael Piganeau (Banyuls, France)
Apports génomiques à la coexistence entre hôtes et virus dans le phytoplancton

Thomas Pradeu (Bordeaux, France)
Le dialogue entre virus mutualistes et le système immunitaire

Andrew Read (Penn State, USA)
Évolution de la virulence virale en réponse à l’intensification des défenses de l’hôte

Roland Regoes (Zürich, Switzerland)
Évolution parallèle du VIH-1 in vitro et in vivo

Marilyn Roossinck (Penn State, USA)
Mutualisme conditionnel et comment il affecte l’évolution

Carla Saleh (Paris, France)
Impact des voie d’activation de la réponse immunitaire innée sur la diversité et l’évolution des virus C de la Drosophile

Rafael Sanjuan (Valencia, Spain)
Évolution sociale des virus

Pauline Scanlan (Cork, Ireland)
Spécificité des interactions entre bactéries et phages dans l’intestin humain

Manuela Sironi (Bosisio Parini, Italy)
Les zoonoses et la Reine Rouge (génétique évolutive des maladies zoonotiques)

Paul Turner (Yale, USA)
Mobiliser les compromis évolutifs et la sélection de pression de sélection des phages pour réduire la pathogénicité des bactéries

Stineke Van Houte (Exeter, United Kingdom)
Comment les phages anti-CRISPR coopèrent pour surmonter l'immunité CRISPR-Cas

Anne-Nathalie Volkoff (Montpellier, France)
Domestication des virus dans les guêpes parasites Ichneumonidae

Lena Wilfert (Ulm, Germany)
Pollinisateurs, plantes et pathogènes – interactions au niveau du paysage

Date limite d’inscription: 21 juin 2019

Droits d'inscription, incluant les frais de séjour (chambre et repas)

460€ pour les doctorants
650€ pour les autres participants

Dépôt des candidatures pour inscription
Le nombre de participants est limité à 115 personnes. Les scientifiques et étudiants en thèse intéressés par la conférence doivent déposer sur le site https://cjm5-2019.sciencesconf.org, avant la date limite :

- leur curriculum vitae
- la copie de leur carte d'étudiant
- la liste de leurs principales publications des trois dernières années
- le résumé de leur présentation :

Le résumé doit respecter le format suivant :
- 1ère ligne : Titre
- 2ème ligne : Nom(s) des auteur(s)
- 3ème ligne : Adresse(s) des auteur(s)
- 4ème ligne : Adresse mail de l'auteur présentant les résultats
Le résumé doit faire au maximum une page A4, rédigé en Time New Roman, taille 10 pts, pas de figures, fichier en format ".docx".

Après la date limite, les organisateurs sélectionneront les participants. Sauf exception admise par le président, il est souhaitable que les candidats sélectionnés présentent leurs travaux pendant la conférence, soit sous forme d'affiche, soit par une brève communication orale en séance. Les organisateurs choisiront la forme sous laquelle se feront les présentations. Les informations sur le mode et la date de paiement seront adressées en temps voulu aux participants sélectionnés.