Evolution des virus : le continuum mutualisme – antagonisme des interactions virus - virus

Président : Paul Turner
Department of Ecology & Evolutionary Biology, 165 Prospect St., Yale University, New Haven, CT  06520 USA
Tel : + 1 203 314 2229
Email : paul.turner@yale.edu

Vice-président : Yannis Michalakis
Maladies Infectieuses et Vecteurs : Ecologie Génétique Evolution et Contrôle (MIVEGEC) UMR Université de Montpellier – CNRS - IRD 5290, 911 avenue Agropolis BP64501, 34394 Montpellier CEDEX 5, France
Tel :
Email : yannis.michalakis@ird.fr

Les interactions entre virus peuvent se produire à l'intérieur d'un individu hôte infecté, où ces interactions virus-virus peuvent inclure les conséquences directes et indirectes d'un génotype ou d'une espèce de virus sur la réussite de l'infection d'un autre virus. L'éventail des résultats s'étend sur un continuum, de sorte que les interactions virus-virus produisent soit des mutualismes (avantages nets en termes de fitness pour chaque virus), soit des antagonismes possibles (désavantages en termes de fitness). Ces interactions peuvent être dues à des infections simultanées de plusieurs virus dans l'hôte, ou elles peuvent résulter des effets d'infections antérieures, telles que des modifications de l'immunité de l'hôte qui suppriment ou renforcent le succès ultérieur de l'infection d'un virus différent. Historiquement, les interactions virus-virus ont souvent été découvertes par hasard. En revanche, des efforts plus récents visent à examiner délibérément le rôle des infections virus-virus dans une grande variété de systèmes biologiques. Il est de plus en plus évident que les interactions virus-virus sont fréquentes et que l'étude de ces relations est cruciale pour la compréhension générale de l'écologie et de l'évolution des virus, ainsi que pour l'élucidation de la pathogenèse et de l’infection virales.

L'objectif de cette conférence Monod est de réunir des chercheurs travaillant sur les virus ayant des compétences variées (épidémiologie, théorie, expérimentation, bioinformatique), qui travaillent sur une myriade de types de virus qui infectent une grande variété d'hôtes. Nous discuterons des idées classiques et nouvelles sur l'évolution des virus, ainsi que de l'importance des interactions entre les virus au sein de l'hôte et de la manière dont elles peuvent influencer l'évolution des virus. Cette conférence arrive à point nommé en raison de la prise de conscience croissante de l'importance des interactions non seulement entre les espèces et les souches virales, mais aussi entre les composants viraux, qu'il s'agisse de particules interférentes "normales", semi-infectieuses ou défectueuses, de satellites viraux ou de segments génomiques, dans la modulation et la détermination des phénotypes viraux et de l'issue de l'infection. Il est important de noter que le contexte écologique de ces interactions est extrêmement pertinent mais (à notre avis) largement négligé dans la recherche sur les virus. Nous espérons donc que cette conférence unique en son genre contribuera à élargir l'intégration de l'écologie évolutive des virus dans les études de virologie.

La conférence portera sur les thèmes suivants :

• Importance des interactions virales dans les maladies
• Écologie évolutive des interactions virales dans les environnements naturels
• Effets des interactions virales sur l'adaptabilité et l'évolvabilité
• Utilisation de concepts d’évolution sociale pour comprendre les interactions entre virus
• Défenses de l'hôte, immunologie et interactions virus-virus

Conférenciers invités

(titres provisoires)

Samuel Alizon (Center for Interdisciplinary Research in Biology (CIRB), Collège de France, CNRS, INSERM, Université PSL, Paris, France)
Dynamique et évolution des papillomavirus humains dans l'environnement vaginal
 

Anne-Claire Baudoux (Station Biologique de Roscoff, Roscoff, France)
Interactions entre virus dans les océans actuels et futurs
 

Stéphane Blanc (INRAE, Plant Health Institute of Montpellier (PHIM), Montpellier, France)
Propagation séparée de gènes distincts de virus multi-composants vers de nouvelles cellules et de nouveaux hôtes
 

Sebastian Bonhoeffer (Dept. of Environmental Systems Science, Institut für Integrative Biologie, ETH, Zurich, Suisse)
Le continuum antagonisme – mutualisme : enseignements et perspectives des plasmides
 

Christopher Brooke (Woese Institute for Genomic Biology, University of Illinois at Urbana-Champaign, USA)
Dynamique collective au sein des populations du virus de la grippe
 

Sam Diaz-Munoz (Dept. of Microbiology and Molecular Genetics, University of California, Davis, USA)
Le côté social de l'échange génétique entre les virus de la grippe A
 

Pilar Domingo-Calap (Institute for Integrative Systems Biology, Universitat de València-CSIC, Valencia, Espagne)
Implications des interactions phage-phage dans la conception de cocktails thérapeutiques phagiques
 

Siobain Duffy (Dept. of Ecology, Evolution and Natural Resources, Rutgers University, New Brunswick, USA)
Evolution du virus du manioc chez les hôtes sensibles, tolérants et "résistants"
 

Santiago Elena (Institute for Integrative Systems Biology, Universitat de València-CSIC, Valencia, Espagne)
De la coopération mutuelle au dilemme du prisonnier et au-delà : comment les génomes viraux affectent le taux de mutation critique dans les modèles de quasi-espèces
 

Lucie Etienne (CNRS, Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), Lyon, France)
(Co)évolution entre hôtes mammifères et virus
 

Sylvain Gandon (CNRS, Montpellier, France)
Plasticité adaptative des cycles de vie viraux
 

Fernando Garcia Arenal (Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas, Universidad Politécnica de Madrid, Madrid, Espagne)
L'effet de l'infection virale sur les plantes sauvages dans la nature dépend de la composante de la fitness et de l'environnement
 

Nolwenn Jouvenet (Dept. of Virology, Institut Pasteur, Paris France)
Le choc des titans : virus à ARN et interférons
 

Britt Koskella (Dept. of Integrative Biology, University of California, Berkeley, USA)
Les bactériophages en tant que concurrents et facilitateurs de compétition dans des communautés complexes
 

Anice Lowen (Dept of Microbiology and Immunology, Emory University, Atlanta, USA)
Des interactions virus-virus bénéfiques au sein des cellules favorisent une propagation efficace du virus de la grippe A
 

Katrina Lythgoe (Dept. of Biology, University of Oxford, Oxford, Royaume Uni)
Comment la sélection intra-hôte affecte l'évolution inter-hôte des virus pandémiques
 

Susanna Manrubia (Centro Nacional de Biotecnología, CSIC, Madrid, Espagne)
Les associations virus-satellite, moteurs de la coexistence virale
 

Jessica Metcalf (Dept. of Ecology and Evolutionary Biology , Princeton University, Princeton, USA)
L'immuno-épidémiologie des interactions virales
 

Yannis Michalakis (CNRS Maladies Infectieuses et Vecteurs : Ecologie Génétique Evolution et Contrôle (MIVEGEC) , Montpellier, France)
Réassortiment chez un virus multipartite
 

Gwenael Piganeau (Integrative Biology of Marine Organisms, Sorbonne University, Banyuls, France)
Evolution des dynamiques phytoplancton - virus et signatures génomiques
 

Roland Regoes (Dept. of Environmental Systems Science, Institut für Integrative Biologie, ETH, Zurich, Suisse)
Épidémiologie expérimentale avec des virus : vers une évaluation de la phylodynamique
 

Philippe Roumagnac (Plant Health Institute of Montpellier (PHIM), Montpellier, France)
Dynamique temporelle des communautés virales associées aux plantes d'une prairie méditerranéenne
 

Rafael Sanjuan (Institute for Integrative Systems Biology, Universitat de Valencia, Valencia, Espagne)
Le rôle de l'utilisation des récepteurs dans les zoonoses virales
 

Mircea Sofonea (Pathogenesis and Control of Chronic and Emerging Infections, University of Montpellier, Montpellier, France)
Modélisation de la dynamique du polymorphisme viral : des interactions intra-hôte à l'épidémiologie et l'évolution
 

Matthew Sullivan (Dept. of Microbiology, Ohio State University, Columbus, USA)
Virologie à l'échelle planétaire : de l'écologie et de la diversité à l'évolution et à la sélection dans les océans mondiaux
 

Paul Turner (Dept. of Ecology & Evolutionary Biology, Yale University, New Haven, USA)
Génétique évolutive des bactéries en réponse aux pressions de sélection des phages individuels versus combinés
 

Lena Wilfert (Institute of Evolutionary Ecology and Conservation Genomics, University of Ulm, Ulm, Allemagne)
Comment l'acquisition de la transmission vectorielle modifie les interactions des viromes d'abeilles
 

Anouk Willemsen (Centre for Microbiology and Environmental Systems Science, University of Vienna, Vienna, Autriche)
Nager avec des géants : fondements des interactions entre les virus géants des protistes
 

Mark Zwart (Dept. of Microbial Ecology, Netherlands Institute of Ecology (NIOO-KNAW), Wageningen, Pays-Bas)
Accepter le bruit : que pouvons-nous apprendre de la variation de la fréquence des segments des génomes viraux ?
 

Date limite d’inscription : 13 juin 2024

Droits d'inscription, incluant les frais de séjour (chambre et repas)

510 € pour les doctorants

740 € pour les autres participants

Dépôt des candidatures pour inscription

Le nombre de participants est limité à 115 personnes. Les scientifiques et étudiants en thèse intéressés par la conférence doivent déposer sur le site, avant la date limite :

• leur curriculum vitae
• la copie de leur carte d'étudiant
• la liste de leurs principales publications des trois dernières années
• le résumé de leur présentation :

Le résumé doit respecter le format suivant :

• 1ère ligne : Titre
• 2ème ligne : Nom(s) des auteur(s)
• 3ème ligne : Adresse(s) des auteur(s)
• 4ème ligne : Adresse mail de l'auteur présentant les résultats

Le résumé doit faire au maximum 600 mots, pas de figures.

Après la date limite, les organisateurs sélectionneront les participants. Sauf exception admise par le président, il est souhaitable que les candidats sélectionnés présentent leurs travaux pendant la conférence, soit sous forme d'affiche, soit par une brève communication orale en séance. Les organisateurs choisiront la forme sous laquelle se feront les présentations. Les informations sur le mode et la date de paiement seront adressées en temps voulu aux participants sélectionnés.